N-glycan from mouse leg muscle

Jin C, Manuscript

Retention Time Recorded Precursor Mass Structure
14.9 1721.0 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
15.4 1397.49 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.19 749.28 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.32 1559.54 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.33 1721.6 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.57 1883.65 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.99 1397.49 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.3 1559.54 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.34 2045.7 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p--2a1D-Man,p--3a1D-Glc,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.5 1745.61 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.62 587.23 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.8 1073.38 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p--2a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.92 1600.57 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.09 1583.55 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--??2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.36 1641.6 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.46 911.36 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.69 1907.66 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.76 1463.55 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p)--6a1D-Man,p--2b2D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.02 895.34 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.17 1987.69 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.4 1235.44 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.7 2255.78 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.81 2239.73 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.91 1729.61 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p--?a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.18 2562.87 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a3D-NeuGc,p}--8a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.18 1787.65 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.77 2094.74 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.77 1729.61 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p--?a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.88 2078.75 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a1D-NeuAc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.98 1057.39 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.19 2401.83 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.22 1875.67 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p--?a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.3 1949.71 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.41 1907.2 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.6 1891.66 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.74 2708.92 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p}(--3a2D-NeuGc,p--8a2D-NeuGc,p)--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.83 1948.69 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.83 2240.8 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuAc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
22.12 1932.69 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
22.5 2620.91 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p(--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p}(--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
22.5 2255.78 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
22.61 2111.0 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-Gal,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
22.61 2239.73 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.14 2708.92 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--6a1L-Fuc,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p}(--3a2D-NeuGc,p)--3a2D-NeuGc,p--8a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.35 2094.74 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.4 2037.72 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p(--3a1D-Man,p)--6a1D-Man,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.56 2078.75 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-NeuAc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.77 2401.83 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--6a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
23.77 2928.0 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p(--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p}((--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.3 3074.0 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p(--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1L-Fuc,p}((--3a2D-NeuGc,p)--6a2D-NeuGc,p)--6a2NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.3 2240.8 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.51 2562.87 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a3D-NeuGc,p}--8a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.62 2255.3 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.78 2239.73 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.9 2766.97 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p(--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p(--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1L-Fuc,p}(--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
25.04 2928.0 [M -1H]1- redEnd--?b1D-GlcNAc,p--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Man,p(--3a1D-Man,p(--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--4b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p)--6a1D-Man,p--2b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p}((--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p)--??2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
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Structure Format

SNFG Oxford Text

Biological Context

Taxonomy - Mus Musculus
Tissue - Leg

HPLC

Column Custom made Hypercarb

Method

  • gradient with 10 ul/min run rate
  • 10 mM Ammonium Biocarbonate
  • 10 mM Ammonium Biocarbonate in 80% AcCN

Mass Spec

Thermo Fisher LTQ Linear Ion Trap ESI

MIRAGE

See report

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