Transient expression of PSGL-1 in CHO with different glycan profile

Chunsheng J, Mthembu Y, Manuscript

Retention Time Recorded Precursor Mass Structure
6.71 384.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
7.05 425.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
8.71 587.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
8.92 675.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
9.42 587.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
9.54 587.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
9.59 733.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
9.62 895.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--4a1L-Fuc,p)--3b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
9.8 587.08 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--3b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.11 879.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.21 1024.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.43 749.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.44 895.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.61 675.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.84 1024.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
10.9 1041.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.03 749.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.14 790.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-GalNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.16 733.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.18 691.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.45 1244.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p)--4a1L-Fuc,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
11.66 813.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p((--3a1D-Gal,p)--4a1L-Fuc,p)--6?1S$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.1 1406.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p)--4a1L-Fuc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.27 966.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.29 1186.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.38 667.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6?1S$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.62 878.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.63 952.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
12.68 982.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
13.15 952.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
13.38 1186.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
13.49 1186.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
13.5 1081.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-GalNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
13.98 1155.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
14.2 1202.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
15.01 848.17 [M -2H]2- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--3a1L-Fuc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-2H,0,redEnd
15.09 1040.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
15.19 1260.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--3b1D-Gal,p)--4a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
15.23 878.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
15.59 1056.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.77 894.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.83 1243.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--4a1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
16.86 878.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-GlcNAc,p--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
17.11 738.25 [M -2H]2- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-2H,0,redEnd
17.81 775.25 [M -2H]2- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-2H,0,redEnd
18.2 1120.17 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--6?1S$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.4 1040.5 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.6 1040.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
18.76 530.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.05 1332.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.33 733.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.37 1186.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
19.63 895.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.69 1041.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
20.77 1405.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.51 1041.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.54 1347.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuGc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.68 1331.25 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
21.97 705.25 [M -2H]2- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p)--6?1S$MONO,Und,-2H,0,redEnd
22.74 1187.33 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p(--4b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--3a1L-Fuc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd
24.06 1186.42 [M -1H]1- redEnd--?a1D-GalNAc,p(--3b1D-Gal,p--2a1L-Fuc,p)--6b1D-GlcNAc,p--4b1D-Gal,p--3a2D-NeuAc,p$MONO,Und,-H,0,redEnd

Structure Format

SNFG Oxford Text

Biological Context

Taxonomy - Cricetulus Griseus
Tissue - Cell Line, Transformed

HPLC

Column Custom made Hypercarb

Method

  • gradient with 10 ul/min run rate
  • 10 mM Ammonium Biocarbonate
  • 10 mM Ammonium Biocarbonate in 80% AcCN

Mass Spec

Thermo Fisher Scientific LTQ Orbitrap ESI

MIRAGE

See report

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